Вариант Х-22НА предназначен для поражения складов, гарнизонов, заводов, железнодорожных станций и портов – крупных стратегических объектов, имеющих точную привязку к местности. В ее системе наведения типа ПСИ был реализован принцип «тихого» полета, управляемого автономной инерциальной системой наведения (ИНС) с коррекцией курса по данным доплеровского измерителя скорости и угла сноса (ДИСС). Перед пуском в нее вводятся координаты точки пуска и цели, определенные самолетной РЛС и НК-45 или же заданные предварительно по известному положению объекта. Сам пуск осуществляется строго в направлении цели, для чего предварительно выполняется «пристрелка» – совмещение оси ракеты по азимуту. На траектории (также задающейся «верхней» или «нижней») чувствительные датчики ИНС, смонтированные на стабилизированной в пространстве гироскопической платформе, выдают на счислитель пути значения полетных ускорений и углов полета. Автопилот корректирует отклонения от курса, заданного при целеуказании перед пуском, а расстояние до цели оценивается по мгновенным значениям скорости и пройденного времени.
Точность такого наведения относительно невысока и достигает нескольких сотен метров, однако она компенсирована снаряжением Х-22НА ядерной БЧ. Такое самонаведение нечувствительно к противодействию средств РЭБ противника, но достижению полной скрытности мешает работа ДИСС, которая может быть засечена радиотехническими системами ПВО.
Вариант ракеты Х-22НП, оснащенный пассивной пеленгационной ГСН, предназначался для уничтожения вражеских РЛС при прорыве ПВО и поражения боевых кораблей, представляющих собой как правило радиоизлучающие объекты значительной мощности. Особенно в этом отношении выделяются авианосцы, имеющие наряду с РЛС различного назначения также радиотехнические средства управления полетами и мощные радиоприводы. Обнаружение и фиксацию местоположения источников излучения и выдачу координат цели осуществляла бортовая система пассивной радиопеленгации носителя «Курс-Н», выдававшая данные на ракету. После пуска Х-22НП шла на цель автономно. Ракета оснащалась осколочно-фугасной БЧ фрагментированного действия, дававшей до 12.000 осколков, что позволяло эффективно поражать не только «сети» антенных систем, но и сами источники излучения. Однако эта система оказалась недостаточно эффективной и уже к началу 80-х г.г. она была снята с вооружения Ту-22М. Причина такого решения заключалась в том, что поиск РЛС, засечение их местоположения и целеуказание ракетам в условиях мощного радиопротиводействия представляет собой очень сложную задачу, для решения которой требуется специальная аппаратура, которой Ту-22М не оборудовались. К тому же для «ослепления» комплексов ПВО лучше подходили специальные самолеты РЭБ, сопровождающие ударные группы ракетоносцев.