В этот же день произошло сразу несколько значимых событий. 29 марта состоялся арест и бывшего наркома НКВД Ягоды, а в Киеве «взяли» начальника УШОСДОР НКВД УССР – старшего майора ГБ Иосифа Марковича Островского. Знаменательно то, что узнав днем по телефону об аресте Ягоды, начальник управления УНКВД по Горьковской области Погребинский вышел в туалет, где застрелился. На следующий день арестовали бывшего секретаря коллегии наркомата П. Буланова.
Конечно, можно допустить, что арест Ягоды и людей из его окружения был неким «происком» Ежова. Но паническое самоубийство Погребинского, являвшегося не только начальником Управления НКВД, но также и руководителем лагерей в Горьковской области, не может быть отнесено в ранг «интриг». Начав чистку ведомства государственной безопасности, Ежов закономерно обратил внимание на Ягоду. В секретном циркуляре от 31 марта, адресованном всем членам ЦК и подписанном Сталиным, сообщалось: «Ввиду обнаружения антигосударственной деятельности и уголовных преступлений наркома связи Ягода, совершенных в бытность его наркомом внутренних дел…», Политбюро «оказалось вынужденным дать распоряжение о немедленном аресте Ягода». И «просит санкционировать исключение Ягода из партии и ЦК и его арест».
Судя по тексту сообщения, этот арест не был запрограммирован. Все произошло спонтанно. Арестом руководил заместитель Ежова Фриновский. Обыск «в квартире бывшего наркома, кладовых по Милютинскому переулку, в Кремле, на даче в Озерках, в кладовой и кабинете Наркомсвязи СССР» длился с 28 марта по 5 апреля. Его проводила группа в составе: комбрига Ульмера, капитанов ГБ Бриля и Деноткина, старших лейтенантов ГБ Березовского и Петрова.
Среди 130 «вещей», внесенных в опись, было: «денег советских 22 997 руб. 59 коп.; вин разных 1229 бут. большинство из них заграничные и изготовления 1897, 1900 и 1902 годов; коллекция порнографических снимков 3904 шт.; порнографических фильмов 11 шт.; костюмов различных заграничных 22 шт.; брюк разных 29 пар; пальто мужск. разных, большинство заграничных 21 шт.; различных заграничных предметов (печи, ледники, пылесосы, лампы) 71; посуда антикварная разная 1008 предметов; к. р. троцкистская, фашистская литература 524; чемоданов заграничных и сундуков 24; резиновый половой член 1».
Начальника Управления НКВД Восточно-Сибирского края комиссара ГБ 2-го ранга Гая Марка Исаевича (Штоклянд Марк Исаакович), который с июня 1934 по ноябрь 1936 г. был руководителем Особого отдела ГУГБ, взяли 1 апреля. О том, какая линия разрабатывалась в это время в чекистском ведомстве в связи с прошедшими арестами, свидетельствует директива, которую 2 марта Ежов разослал управлениям ГУГБ. Она была озаглавлена тезисом: «Об усилении борьбы с агентами германской разведки».