Сам Андрей Тимофеевич тщательно вел дневники и журналы всю свою сознательную жизнь. Это в значительной мере помогло ему сделать замечательные научные открытия.
Указанные шесть отделений Болотов описывал следующим образом.
Отделение для посева семян. Так как грядки в нем занимались культурой три года, то весь участок делился на три части и посев чередовался (на четвертый год он снова шел на первые грядки).
Отделение для посадки черенков смородины и крыжовника, «отрывков» яблони и груши и тех сеянцев из первого отделения, которые отстают в росте и не могут быть высажены в срок на постоянное место. Это отделение тоже было разбито на три части.
Участок сада, предназначенный для выращивания плодовых кустарников. Сюда высаживались саженцы из второго отделения и другой посадочный материал.
Участок сада для выращивания косточковых деревьев (вишня, слива, терн).
Ученый указывал, что третий и четвертый участки должны занимать значительно большую площадь по сравнению с первым и вторым отделениями, так как растениям, высаженным на постоянное место, требуются большие площади питания.
Отделение для яблонь, переводимых из первого отделения после прививки.
Отделение для высадки яблонь из первого отделения, не нуждающихся в прививке.
Болотов писал, что последние два отделения должны быть еще более обширными по площади и занимать основную часть сада.
Особое внимание Болотов обращал на дальнейшую судьбу «сеяных почек» (сеянцев), которые предназначаются для выращивания без прививки.
Он указывал на признаки, которыми следует руководствоваться при отборе таких сеянцев.
Это, во-первых, - происхождение (сеянцы из семян хороших сортов); во-вторых - морфология (сеянцы с более крупными листьями, темной и толстой корой): в-третьих - поведение сеянца при прививке. Последний признак Болотов установил в результате своих наблюдений за приживаемостью прививок имевшихся у него сортов яблони на различные подвои. Ученый обнаружил также, что на яблонях со сладкими плодами прививки, как правило, не приживаются.
Болотов подчеркивал, что хорошая наследственность еще не обеспечивает успех дела. При плохом уходе даже хороший сорт даст яблоню с плохими плодами. И наоборот, если у сеянца подрезать главный корень, чтобы корневая система расположилась в верхних слоях почвы, и он будет хорошо освещаться солнцем, а почва вокруг него останется чистой и рыхлой, то яблоня скорее начнет плодоносить и плоды у нее будут крупными и сладкими
Не меньшее внимание Андрей Тимофеевич уделял и тем сеянцам, которые подлежали прививке. Он считал очень важными выбор подвоя и технологию прививки.