Отдельные батальоны народного ополчения и отряды НКВД сражались в метро: продвигаясь по его тоннелям и используя вентиляционные шахты, они появлялись в тылу у немецких войск и нападали на них там, где те их меньше всего ожидали. Чтобы их выкурить, немцы принялись сбрасывать туда тюки горящих солдатских одеял, которые предварительно пересыпали толченой серой и обливали дизтопливом. Едкий вонючий дым потянулся в глубь тоннелей, однако этот способ благодаря продуманной вентиляции сработал далеко не везде, в результате чего ожесточенная борьба с опорой на станции метрополитена в Москве продолжалась еще в течение нескольких дней!
Немецким солдатам нередко в кромешной тьме приходилось вести бои среди самых настоящих дворцов, увидеть которые здесь, под землей, они никак не ожидали. Однако когда они уже готовились торжествовать победу, кто-то из оборонявшихся, чье имя по понятной причине так и осталось неизвестным, взорвал своды тоннеля, проходившего под Москвой-рекой, и ее воды хлынули в подземелье, сметая все на своем пути. Вода затопила метро в считаные минуты. Кто-то, разумеется, спастись успел, однако большинство из тех, кто в это время сражался под землей, включая и немцев, и остававшихся там бойцов Красной Армии, а также ополченцев, были застигнуты врасплох и утонули.
Давление скопившегося под землей воздуха оказалось настолько сильным, что во многих местах оно вызвало обрушение тоннелей и зданий, располагавшихся над ними на поверхности, а на многих улицах из-под земли вдруг совершенно неожиданно забили фонтаны, на месте которых впоследствии образовались опасные провалы.
Ворота в Кремль были взорваны, и оборонявшиеся там части НКВД уничтожены поголовно. И хотя к 8 октября сопротивление защитников Москвы в основном уже было подавлено, ночами то тут то там слышались перестрелка и взрывы гранат, а немецкие патрули исчезали один за другим. Вот почему армейские части вскоре были выведены из города, а их место заняли войска СС и СД. Начались повальные обыски, поиск коммунистов и евреев, которых расстреливали и вешали прямо на центральных улицах либо в прилегающих к ним садах и парках прямо на деревьях и фонарных столбах. От населения тут же потребовали сдать все оружие и радиоприемники: хранить и то и другое запрещалось под страхом смертной казни. Стараниями гестапо среди части москвичей распространилось доносительство, причем даже еще в больших масштабах, чем в 1937 году. Сосед доносил на соседа, что тот бывший коммунист или же тайный агент НКВД, а тот, в свою очередь, чтобы избавиться от пыток, сообщал любую информацию о своих знакомых и сослуживцах. И хотя надежды гитлеровцев на «пятую колонну» среди москвичей, по большому счету, так и не оправдались, сам факт падения столицы подействовал на сознание многих людей настолько сильно, что они пошли на сотрудничество с оккупантами и теперь делали все, что-бы выслужиться перед ними и спасти свою жизнь ценой какого угодно предательства.