Многие борцы вольного стиля первыми были призваны в ряды Красной Армии и встали на защиту Родины. Из них в живых осталось не более трех процентов, да и те в большинстве своем остались инвалидами. А.А. Харлампиев с первых дней войны воевал в народном ополчении, получил тяжелое ранение и потом служил в госпитале инструктором лечебной физкультуры. Его опыт и знания вернули здоровье многим раненным бойцам. Многие погибли как герои, но имена их не ведомы… Однако отдельные эпизоды все же попадали «на карандаш» военных корреспондентов. Чемпион Ленинграда В. Данилин шел на лыжах с донесением. У старого кладбища на него неожиданно напали три вражеских разведчика. Виктор бросил ближнего передним переворотом на острия могильной ограды, выбил оружие у второго и оглушил им третьего. Неудачливые охотники за «языком» сами попали в плен.
В 1943 году под Гомелем чемпион УССР по борьбе вольного стиля Б. Цюпа вошел с двумя партизанами в одну из деревень. Неожиданно они наткнулись на группу гитлеровцев. Отступать было поздно и Цюпа бросился на ближнего, сбил его подсечкой, второго подножной бросил на стоящих рядом. Товарищи открыли огонь по убегающим фашистам, решившим, что на деревню напал большой партизанский отряд.
В период Великой Отечественной войны соревнований на первенство страны не проводилось. Работа Всесоюзной секции борьбы вольного стиля прервалась. Многие члены ее президиума были в войсках. Закрылись спортивные секции в ВУЗах и спортивных клубах предприятий. Многие специалисты по борьбе вольного стиля за время Великой Отечественной войны приобрели новые военные специальности и были оставлены в кадрах Советской Армии: Н.Я. Гладков, В. Сидоров, А.М. Ларионов, Н.М. Галковский, И. Пономаренко, М.Т. Данилин и другие… Получившие тяжелые ранения Э.Л. Портнов, Е.П. Щукин, С.Н. Чухров так и не смогли снова выйти борцовский ковер. Подавляющее же большинство борцов с фронта не вернулись.
По окончании Великой Отечественной войны и расформировании 183-го армейского госпиталя методист лечебной физкультуры старший лейтенант А.А. Харлампиев отделом кадров Главного санитарного управления Советской Армии в октябре 1945 года просьбе ЦС «Динамо» был откомандирован в его распоряжение. Там он проработал до 5 января 1953 года. В послевоенное время оказалось, что в ДСО «Динамо» борцов вольного стиля сохранилось больше, чем где-либо. Это были те бойцы, которые несли службу в тыловых организациях или органах милиции, хотя большинство динамовцев в годы войны погибло. Как уже было сказано, в большинстве профсоюзных и студенческих ДСО борьба вольного стиля в период войны не культивировалась, так как основная часть спортсменов была призвана в действующую армию, а годные к нестроевой службе мобилизованы для проведения занятий по обучению приемам рукопашного боя в запасные части, или занимались с допризывниками при райвоенкоматах. По окончании войны секция борьбы вольного стиля ДСО «Динамо» стала в Москве ведущей, ведь помимо тех, кто занимался в ней раньше, туда пришло много спортсменов, оставшихся без тренеров и спортивных залов. В таких условиях возрождалась в Москве борьба вольного стиля.