Уже в январе 1943 года появились первые проекты, в которых в качестве силовой установки для «Блица» использовались два двигателя Heinkel-Hirth HeS 011 конструкции доктора Ханса Йохима Пабста фон Оана (Hans Joachim Pabst von Ohain). Они должны были развивать тягу около 1300 кг на уровне моря. Это были необычайно интересные двигатели. В их конструкции было использовано уникальное сочетание осевого нагнетателя с центробежным. Однако сложная конструкция стала причиной больших проблем, которые не удалось решить до самого окончания войны. Было построено только 19 прототипов и десять серийных двигателей HeS 011.
В конце 1943 года было разработано два проекта версии Ar-234 D оснащенной этими двигателями. Первым из них был Ar-234 D-1 – разведывательный самолет с фотокамерами в фюзеляже, а вторым Ar-234 D-2 – бомбардировщик, переносящий до 1000 кг боевой нагрузки. Существовал еще проект штурмовика – Ar-234 D-3. Совершенно новой была в варианте «D» герметичная кабина пилота. Она имела более «бульбообразные» очертания и остекление, существенно выходящее за обводы фюзеляжа. Вооружение варианта Ar-234 В-1 должны были составить две пушки MG 151/20, в ванне под фюзеляжем, стреляющие назад. Ar-234 D-2 должен был иметь две таких пушки под фюзеляжем и две в задней части фюзеляжа – набор подобный тому, который планировался для Ar-234 С-3.
Бомбы подвешивались как под фюзеляжем, так и под гондолами двигателей. Длина самолета возросла до 12,78 м, а стартовая масса до 9850 кг. Максимальная расчетная скорость – 830 км/час на высоте 4000 м, а дальность 1500 км, при полете на высоте 12000 м. Среди сорока построенных и планировавшихся к постройке прототипов Ar-234 несколько должны были стать образцами версии «D», оснащенными двигателями HeS 011. Однако ни один из них не был окончен именно в такой конфигурации из-за проблем, возникших при доводке двигателя. В соответствии с немецкими документами (рапорт от 27.12.1944 года), первоначально как прототипы версии Ar-234 D предполагались самолеты с V33 до V40 (V33, V36, V39, V40 – Ar-234 D-1; V34, V37 – Ar-234 D- 2; V35, V38 – Ar-234 D-3). Как уже упоминалось – в январе 1945 года их предназначение было изменено, и они использовались в программе по испытанию новых крыльев.
Вариантом тяжелобронированного штурмовика должен был стать Ar-234 Е. Самолет должен был оснащаться двумя двигателями Jumo 004С или HeS 011. Вооружение состояло из пушки МК 103 калибра 30 мм в контейнере под фюзеляжем и двух MG 151/20 в нижней части кабины пилота. В других вариантах можно было подвешивать под гондолами двигателей и фюзеляжем дополнительно три пакета «Magirusbombe», каждый из которых содержал по две пушки MG 151/20. Самолет мог также переносить ракетную бомбу SC-500 RS.