Стоит отметить еще один немаловажный факт, отрицательно повлиявший на активность организации. Основные денежные вливания в «Палестинский Исламский Джихад» поступали из иранских источников. В месяц только из Ирана поступало около 400 тысяч долларов США. Как правило, они оседали на личных счетах шейха Фатхи Шкаки в швейцарских и других европейских банках, поэтому после его смерти этими счетами никто не смог воспользоваться, так как не сохранилось никакой информации касательно этих счетов.
На сегодняшний день «Палестинский Исламский Джихад» продолжает оказывать значительное влияние и в секторе Газа, в основном в Исламском университете. Сторонники организации контролируют 24 мечети в секторе Газа. Через имамов и шейхов организация проводит постоянную агитационно-подстрекательскую работу, таким образом пополняя свои ряды. Боевое крыло организации действует мелкими, хорошо обученными группами добровольцев. С первых шагов создания организации шейх Фатхи Шкаки открыто заявлял о том, что не собирается превращать «Палестинский Исламский Джихад» в массовое движение. По его мнению, новая организация должна была стать «…наконечником стрелы, которая со временем приведет массы к исламскому перевороту и священному джихаду…». «Палестинский Исламский Джихад» намного малочисленнее других исламских террористических организаций, однако его члены наиболее идеологически подготовлены. Даже среди палестинцев бытует мнение, что члены организации «Палестинский Исламский Джихад» отличаются своей непримиримостью и крайней жестокостью.
За последние десять лет своего существования, находясь на полном обеспечении Ирана, «Палестинский Исламский Джихад» превратился в ближайшего союзника «Хизбаллы», получив свободный доступ к тренировочным лагерям проиранских террористических организаций. Существует также множество неоспоримых доказательств тесных контактов «Палестинского Исламского Джихада» и террористической организации «Аль-Каеда». Фактически «Палестинский Исламский Джихад» превратился в одно из отделений «Аль-Каеды» на Ближнем Востоке.
Говоря о палестинской исламской террористической организации «Палестинский Исламский Джихад», нельзя еще раз не отметить роль ее основателя, военного руководителя, политического и духовного лидера шейха Фатхи Шкаки. Современное цивилизованное общество никак не может понять, что в начале 80-х Шкаки создал организацию, сравнимую с опасным вирусом, который крайне сложно уничтожить. Конечно, Шкаки не был единственным ее создателем, однако его организация во многом оправдала надежды ее основателя, став «наконечником стрелы». Этот «вирус» можно приглушить на какое-то время, быть может, на несколько десятилетий забыть о его существовании, но в определенный час он вновь может напомнить о себе, разразившись смертельной болезнью, подобно средневековой чуме, уничтожившей более трети населения Европы.