В процессе эксплуатации Су-17 показал себя достаточно надежным самолетом. Большинство потерь случалось по вине личного состава— ошибок в пилотировании, нарушения полетных заданий и эксплуатационных ограничений. Так, за 1988 год в ВВС СССР потери составили 9 машин, и все они были разбиты по вине летчиков. Даже в 1993 году, с резким снижением налета часов, сказавшимся на росте аварийности, из 23 потерянных самолетов ВВС и АВМФ России оказался лишь один Су-17УМЗ, разбитый из-за помпажа двигателя. Видимо последней потерянной машиной этого типа в республиках бывшего Союза стал украинский разведчик Су-17М4Р из Коломыи, упавший в июле 1998 года после столкновения с птицей.
К завершению производства Су-17 в 1990 году в ВВС СССР насчитывалось 1095 самолетов этого типа. Всего же вместе с экспортными было построено 1866 машин. Подписание к ноябре 1990 года Договора об обычных вооруженных силах в Европе требовало некоторого уменьшения их количества. Немало Су-17 предстояло сократить в числе 773 боевых самолетов, выводившихся из состава ВВС, а часть учебно-боевых машин могла быть «разоружена» и переклассифицирована в учебные. Срок выполнения договоренностей устанавливался в 40 месяцев, однако последовавшие вскоре события внесли свои коррективы. С распадом СССР часть Су-17 сменила принадлежность, отойдя к суверенным ВВС в частности к Украине. В российских ВВС к концу 1993 года предусматривался полный вывод из эксплуатации Су-17, как и прочих боевых однодвигательных самолётов. В строю должна была остаться только новейшая авиатехника Снятые с вооружения машины передавались на базы хранения, на разделку или предлагались на продажу заинтересованным государствам.
Прошедшие Афганистан «спарка» Су-17УМЗ и разведчик Су-17МЗ (внизу) из 101-го разведполка.
Затяжной экономический кризис, сокративший поставки новых самолетов до минимума вынудил сохранить Су-17 на вооружении несколько дольше. К январю 1997 года в строю оставались еще два полка ИВА. Однако в процессе реформы ВВС с вооружения была снята не только сама машина—в соответствии с Указом президента России от 16 июля 1997 года ВВС и войска ПВО объединялись, и в новой структуре ИБА места не нашлось Род авиации, образованный волевым решением 40 лет и 2 месяца назад, таким же приказным порядком был упразднен а его функции переходили к ФБА и ШA, для замены которых ИВА когда то создавалась. Вместе с тем разведчики этого типа продолжали летать в российских ВВС. Последней «ударной» частью на «сушках» стала 43-я отдельная морская штурмовая эскадрилья авиации Черноморского Флота в Гвардейском. Крымские летчики, отказавшись переходить под юрисдикцию Украины, накрасили на свои самолеты андреевские флаги продолжали летать на Су-17М4 до января 1998 года, двумя годами позже сменив их на Су-24.