«Новое веяние захватывало даже таких слабых людей, как царь Федор, слывший за великого любителя всяких наук, особенно математических, и… заботившийся не только о богословском, но и о техническом образовании: он собирал в свои царские мастерские „художников всякого мастерства и рукоделия“, платил им хорошее жалованье и сам прилежно следил за их работами».
В. О. Ключевский
Как прежних царей, так и царя Федора Алексеевича очень беспокоило плохое состояние русского войска, которому особенно вредило местничество.
«При каждом новом походе собирали помещиков и делались назначения по службе… и тот, кого назначали на низшее место, справлялся, бывали ли его предки или живые родственники на таких местах. Справлялся он в книгах, которые назывались Разрядными, в которых были записаны все назначения на службу, кто какое место получал… Человек не шел на службу, потому что боялся больше всего своим понижением понизить целый свой род, всех своих родственников, от которых ему житья бы тогда не было».
С. М. Соловьев
Итак, местничество приносило большой вред, так как приходилось назначать на высокие места по значимости рода, а не по заслугам и способностям.
Наконец, в заседаниях Боярской Думы (1682 г.) было решено уничтожить местничество; разрядные книги, куда записывались все распоряжения правительства по военной и гражданской службе, были сожжены, причем царь сказал, что он велит записывать для памяти потомства знатные фамилии в особые родословные книги.
При Федоре Алексеевиче продолжалась война за Малороссию (Украину). В южной части Малороссии держался украинский гетман Дорошенко, перешедший под покровительство Турции, которая вследствие этого считала Украину своей. Московские воеводы после упорной обороны вынуждены были уступить туркам столицу правобережных гетманов г. Чигирин. Так как долгая война за Украину и постоянные набеги крымских татар (турецких вассалов) совсем разорили правый берег Днепра, то правобережное казачество стало уходить, массами переселялось на восток, на левую сторону Днепра, в область Сев. Донца (Слободская Украина). Московское правительство, по-видимому, не особенно дорожило опустошенными правобережными областями и уступило их (кроме Киева) турецкому султану по договору, заключенному в 1681 году (в Бахчисарае). Война с Турцией завершилась 20-летним перемирием.
Царь Федор Алексеевич умер в 1682 г. бездетным. Осталось два брата: 15-летний Иван, болезненный и слабоумный, и 10-летний Петр — здоровый, живой, даровитый мальчик. Патриарх Иоаким и бояре решили провозгласить царем Петра.