Обязанности госпитальеров для ордена не ограничивались Мальтой. Они обеспечивали на Средиземноморье, если можно так сказать, силы милосердия. В январе 1693 года, к примеру, когда город Аугуста на Сицилии был разрушен землетрясением, пять галер немедленно были отправлены на место трагедии, чтобы обеспечить любую возможную помощь местным жителям. Это землетрясение вызвало разрушения и на Мальте (остров, где сейсмическая активность очень редка), но орден тем не менее выполнил свой христианский долг и отвез врачей, еду и одежду сицилийцам. В 1783 году, когда порт Реджо в южной части Калабрии и Мессина на Сицилии пострадали от землетрясения, весь флот ордена был отправлен на помощь.
Судя по записям, госпиталь в Валетте послал на корабли своих лучших хирургов, а также медикаменты, палатки для людей, оставшихся без крова, и двести кроватей. Тот факт, что маленький остров смог оказать существенную помощь своему намного более крупному соседу, свидетельствует о процветании Мальты под властью рыцарей. По этому поводу правительство Бурбонов в Неаполе было настолько раздосадовано собственной неэффективностью, тем более в сравнении с активной помощью рыцарей, что даже выразило протест великому магистру Эммануэлю де Рогану. В нем утверждалось, что королевство обеих Сицилий никогда не просило о помощи и потребовало, чтобы орден увел свои корабли. Де Роган ответил, что орден делает все то, что делал столетиями, – помогает христианам в беде. Этот ответ, судя по всему, урезонил короля Фердинанда, потому что рыцарям больше никто не чинил препятствий, и они соорудили для пострадавших временный госпиталь в Мессине.
Как и в самом священном госпитале на Мальте, где большое внимание уделялось полноценному питанию, люди, служившие на кораблях ордена, получали лучший рацион, чем моряки других флотов XVII и XVIII веков. Хлеб, овощи, печенье, масло и вино выдавалось всему экипажу. Вино играло большую роль, когда гребцы выказывали признаки сильной усталости – во время долгих жарких штилей средиземноморского лета или когда им надо было резко нарастить скорость, чтобы догнать противника. Свежее мясо, «говядина на копытах», всегда грузилось на корабль перед уходом с Мальты. По возможности, когда всех животных забивали, их заменяли в других портах захода. Кур тоже перевозили на борту, и рацион разнообразился куриным бульоном и яйцами. Базовый неприкосновенный запас продовольствия – сухари, солонина и рыба – рассчитывался таким образом, чтобы галера могла при необходимости провести в море два месяца без пополнения запасов.