Таким образом, основными результатами смуты годов Хогэн стало существенное ослабление рода Минамото, в одночасье лишившегося многих представителей основной ветви рода, и усиление позиций рода Тайра, показавшего себя более лояльным к правившему тогда императору Го-Сиракава.
Дальнейшие события описаны в «Повести о смуте годов Хэйдзи», перевод которой мы публиковали ранее, и в «Повести о доме Тайра». Через три года после подавления мятежа Хогэн Минамото-но Ёситомо сговорился с Фудзивара-но Нобуёри, который был недоволен задержкой в продвижении в чинах. Воспользовавшись тем, что Киёмори уехал на богомолье в Кумано, в девятый день двенадцатой луны первого года Хэйдзи (1159) они напали на дворец, захватили правящего императора Нидзё и экс-императора Го-Сиракава и вынудили к самоубийству главного политического оппонента Нобуёри, Фудзивара-но Митинори (монашеское имя — Синдзэй). Тайра-но Киёмори спешно вернулся в столицу и с помощью своих сторонников устроил побег Нидзё и Го-Сиракава. Нидзё перевезли в поместье Рокухара, принадлежавшее Тайра, а Го-Сиракава бежал в храм Ниннадзи, находившийся на западном краю столицы (как мы увидим далее, подобная тактика — бежать, выждать и примкнуть к победителям — вообще была ему свойственна). Войско Киёмори подступило к дворцу; после недолгого боя нападающие сделали вид, что враг им не по силам, и отступили. Таким обманным манёвром Киёмори удалось выманить войско мятежников из дворца, и его тут же заняли отряды Тайра, а армию мятежников разбили основные силы правительственных войск. Минамото-но Ёситомо и Фудзивара-но Нобуёри бежали, но Нобуёри, не выдержав тягот пути, сдался и был казнён, а Ёситомо, направлявшийся на восток, где потомки Минамото-но Ёсииэ пользовались авторитетом, остановился у своего вассала Осада Тадамунэ в земле Овари (вблизи нынешнего г. Нагоя). Тадамунэ предложил Ёситомо помыться с дороги, а сам подослал к нему своих людей, которые и зарубили Ёситомо, когда он был раздет и безоружен. Тадамунэ наградили, а голову Ёситомо повесили у ворот темницы.
После мятежей годов Хогэн и Хэйдзи на первые должности в государстве назначают Тайра — наступило время, когда некоторые из них говорили: «Тот не человек, кто не из нашего рода!» («Повесть о доме Тайра», св. 1 «4. Кабуро», пер. И. Львовой). Киёмори выдал свою дочь за императора Такакура, их сына объявляют наследником престола, а потом и императором. Важнейшие политические дела вершит глава рода Тайра, Киёмори. В 1180 году он даже настоял на переносе столицы в Фукухара, которая находилась рядом с его родовым поместьем, на территории нынешнего портового города Кобэ. Однако в том же году вспыхнул мятеж принца Мотихито, и с этих пор начался закат могущества Тайра. Столицу вернули в Киото и сосредоточили все силы на подавлении восставших Минамото, которые начали военные действия, как только получили указ принца Мотихито об усмирении рода Тайра. Возглавил восставших пребывавший в ссылке в местности Идзу Минамото-но Ёритомо, сын Ёситомо, погибшего в годы Хэйдзи, а в решающих сражениях командовал войсками младший брат Ёритомо, Ёсицунэ.