Такие выступления еще никогда не проходили безнаказанно. И вот Гус получил вызов в Констанц, город, в котором в то время собрались церковники всех стран Европы. Положение церкви стало не на шутку беспокоить верхи феодального общества. Жадность и разврат многочисленного духовенства постепенно переполнили чашу народного терпения. Наиболее дальновидные церковники говорили о необходимости устранить самые вопиющие нарушения церковной дисциплины. Желая таким образом обновить обветшавшее здание церкви, они хотели сделать все возможное для того, чтобы она могла и впредь удерживать угнетенные массы в повиновении. С этой целью решено было созвать собор, т. е. собрание церковников из всех стран католической Европы. Местом собора был избран город Констанц, расположенный в верховьях Рейна.
Констанцский собор начал свои заседания в ноябре 1414 г. Перед ним стояли три задачи: борьба с искажениями католического учения, прекращение церковного раскола (в это время часть католических стран признавала одного папу, а другие страны — другого) и, наконец, «обновление и преобразование» церкви. Подстрекаемый папой собор взялся прежде всего за обсуждение дела Гуса, который решился приехать в Констанц и лично выступить перед собором.
Путь Гуса из Праги в Констанц через германские земли явился подлинным триумфальным шествием великого проповедника. На всем его протяжении собирались толпы народа, чтобы поглядеть на знаменитого обличителя церковных пороков. Это было прекрасным доказательством того, что простые люди не верили ложным слухам о «ереси» Гуса, которые усиленно распространялись его врагами.
Когда Гус прибыл в Констанц, ему торжественно вручили специальную охранную грамоту императора, а папа снял с него церковное отлучение. Однако на двадцать пятый день после приезда в Констанц Гуса схватили, заковали в цепи и бросили в тюрьму.
Католические инквизиторы считали, что Гуса недостаточно физически уничтожить, гораздо важное заставить от «раскаяться», отречься от — своих взглядов. Тем самым они хотели нанести чувствительный удар не только по чешскому антицерковному учению — реформации, но и по всем антикатолическим выступлениям в Европе. Поэтому Гуса долго томили в заточении в сырой смрадной камере, находившейся глубоко под землей, рядом со сточной трубой. Но Гус не был сломлен. Он не желал отречься от своих взглядов. Тем временем собор рассматривал другие вопросы.
Но вот настал день, когда в зал заседания собора привели великого чешского патриота. От Гуса потребовали отречения от всех ересей, в которых его обвиняли. При этом Гусу не давали возможности оправдаться: его защитная речь заглушалась и прерывалась свистом, топотом и угрозами «благочестивых отцов», заседавших на соборе. Злонамеренно исказив взгляды Гуса, католический собор осудил его и 6 июля 1415 г. передал, по лицемерному выражению попов, «в руки светского правосудия».