Двойственным было отношение Швейцера и к миссионерской деятельности христианской церкви. Он осуждал церковников за то, что именем бога они прикрывают совершаемые в колониальных владениях неправедные деяния[11]. В то же время доктор Швейцер испытывал «искреннее и глубокое уважение к работе, которую здесь (во Французской Экваториальной Африке. — В. П.) начали американские миссионеры и которую затем продолжили миссионеры французские»[12].
Дело в том, что миссионерство на различных этапах его осуществления по-разному воспринималось африканским населением. В 60 — 70-х годах XIX столетия оно пользовалось среди африканцев успехом. Первые миссионеры появились задолго до военных вторжений. Они пытались объединить враждующие племена, несли образование, новые прогрессивные орудия труда, лекарства. Многие из них были идейными людьми и искренне желали местным жителям добра[13].
Швейцер положительно оценивал культурную и объединительную функции миссионерства и был более сдержан в общей оценке этого явления. Его привлекали лишь те деятели миссионерского движения, которые не искали в Африке наживы или карьеры, а стремились быть полезными местному населению.
Обильную пищу для размышлений дают и широко цитируемые Фрайером теологические труды Альберта Швейцера. Важнейшие из них посвящены исследованию деятельности Иисуса, которого Швейцер считал реально существовавшей исторической личностью, и апостола Павла, предполагаемого автора одного из евангелий. Как теолог Швейцер не помогал христианской церкви возвеличить Иисуса — сына бога. Уже в конце первого года обучения в Страсбургском университете молодой исследователь христианских догматов «стал сомневаться в историческом обоснование речей и поступков Иисуса»[14]. Позднее, в 1897 году, работая над сравнением гипотезы Ф. Шлейермахера о тайной вечере с Новым заветом, Швейцер подметил, что объяснение явления Иисуса в позднейших источниках не согласуется с таковым у ранних христиан[15].
Этот критический настрой нашел отражение в таких трудах, как «История изучения жизни Иисуса» (1906), «Психиатрическое исследование личности Иисуса» (1913), «Мистика апостола Павла» (1930). Швейцер отрицал божественное происхождение Иисуса, но признавал историческую достоверность его существования. Ученый видел в Иисусе прежде всего проповедника, создателя религиозно-этического учения и ставил его в ряд с другими иудейскими проповедниками того времени. По мысли Швейцера, этика христианства, которой церковь приписывает божественное происхождение, является плодом деятельности человека. Она, как и всякий продукт человеческой деятельности, подвержена изменению и развитию. В докладе, прочитанном во Французской академии социальных наук в 1952 году, Швейцер рассматривал этику христианства в системе других этических учений, указывая на ее исторически ограниченный характер