Учитывая то, что Севастополь достаточно долго не тревожила немецкая авиация, работавшая в основном по Керчи, бдительность ПВО города была ослаблена. Ряд зенитных батарей был снят со своих позиций, и многие батареи уже находились в готовности к отправке на Большую землю. В связи с этим «внезапный» удар люфтваффе оказался очень болезненным. Но целью немецкой авиации стал не город. В боевом отчете 4-го авиакорпуса указано: «Основной задачей дня стала атака морских целей и атака гавани Севастополя»89.
По данным «Хроники боевых действий ЧФ», 12 ноября 1941 года в 8:30 из Севастопольской гавани вышел транспорт «Красная Кубань», имя на борту 214, 215 и 216-ю зенитные батареи ЧФ. По советским данным, при проходе бонового заграждения его атаковали три немецких пикировщика. Теплоход, резко меняя скорость хода, затруднял им прицеливание. Бомбы падали вблизи судна, но не причиняли крупных повреждений. Теплоход, получив лишь осколочные пробоины в корпусе, успешно завершил рейс90. Это советские данные, но противник о действиях пикировщиков Ju-87 в это время в этом районе в своих документах ничего не указывает. В отчете 4-го авиакорпуса указывается, что группа III./St.G77 атаковала цели на Керченском полуострове и в порту Керчь. 4 самолета атаковали сухопутные цели, 14 самолетов наносили удар по кораблям на подступах к Керченскому порту, 12 самолетов атаковали сам порт. Их прикрывали 12 истребителей эскадры JG 7791. По данным противника, Севастопольскую бухту атаковали не пикирующие Ju-87, а бомбардировщики He-111 и Ju-88: часть группы III./KG 27 и авиагруппа I./KG 5192. Кроме того, судя по немецким аэрофотоснимкам, «Кубань» на момент налета немецкой авиации оставалась на месте, у причала.
Начиная с утра 8 ноября, в течение трех суток, крейсер «Червона Украина» вел огонь, не меняя своего положения, поддерживая части СОР, сражавшиеся в районе деревни Кара-Коба. Командир крейсера капитан 2-го ранга И.А. Заруба трижды запрашивал командование ЧФ о смене позиции и не получал никаких указаний на этот счет.
В 9 часов над бухтой прошли два немецких самолета-разведчика из 3F./121, зафиксировавшие расположение боевых и ремонтирующихся кораблей в Севастопольской бухте. Первый удар наносили 12 самолетов Не-111Н-6 из группы III./KG 27. Удар наносился по «крейсеру, стоящему в бухте у причала, северо-восточнее Верфи»93. Но в данном фрагменте речь идет не о «Червоной Украине», а об атаке на эсминец «Беспощадный», стоявший на ремонте в Килен-бухте. Анализ документов показал, что противник часто принимал эсминцы 7-го проекта за крейсера.