13 августа 1941 года, после объявления Германией войны Советскому Союзу, с Ф. А. Изенбеком случился удар и он умер. Бельгия была оккупирована нацистами. Ю. П. Миролюбов потом написал, что дощечки «Книги Велеса» тогда же были «изъяты гестапо вместе с 600-ми его картинами». В письмах Ю. П. Миролюбова упоминается также некий Шеффель (коего по недоразумению Сергей Лесной назвал в своих книгах Пфефером, ибо воспроизводил имя по памяти и со слуха). Сей Шеффель, немец, эмигрант из России, был ассистентом в Византийском отделе Брюссельского университета у профессора Экка и интересовался дощечками, предлагал свою помощь в расшифровке текстов. Потом он вступил в фашистскую организацию Einsatzstab, входившую в состав «Himmler’s Ahnenerbe» («Наследие предков»), и, возможно, присутствовал при изъятии картин Изенбека. «Ahnenerbe» занималась этно-культурными исследованиями в оккультном нацистском духе, устраивала экспедиции на Тибет, собирала исторические реликвии на оккупированных территориях.
Если действительно существовал византолог Шеффель, то тогда «Книга Велеса» могла сохраниться в архивах этой организации. А где они находятся теперь? Известно, что большая часть архивов «Ahnenerbe» после войны перешла в руки советского командования. Затем они тайно хранились (и по сию пору хранятся) в Москве. К ним не подпускают никого. Они как бы не существуют, подобно иным тайным военным трофеям. И кто знает, может быть, лежат там среди других реликвий мировой культуры также и дощечки «Книги Велеса». Однако все это может быть не более чем фантазией.
Вернемся в послевоенные годы. После исчезновения «Книги Велеса» прошло семь лет. В 1948 году Ю. П. Миролюбов написал письмо в Русский Музей в Сан-Франциско, в коем сообщал о пропавших дощечках «Книги Велеса». Но вначале на сие письмо не обратили внимания.
Потом, в ноябре 1953-го года, в журнале «Жар-птица», издававшемся русскими эмигрантами в Сан-Франциско (первоначально ротапринтом), была опубликована заметка, в коей сообщалось о том, что с помощью Ю. П. Миролюбова «отыскались в Европе древние деревянные «дощьки» V века с ценнейшими на них историческими письменами о древней Руси».
Изучение архивов Ю. П. Миролюбова, его переписки, всех последующих публикаций о «Книге Велеса» позволяет сделать вывод, что к тому времени существовала сделанная от руки копия «Книги Велеса» (возможно, отдельные дощечки копировались и сверялись несколько раз), также были сделаны три фотокопии и две «световые копии» (не знаю, что это такое). Все сии копии были сделаны Ю. П. Миролюбовым в 1924–1941 годах в мастерской Изенбека в Брюсселе.